植物甾醇酯的消化吸收和代謝過程是一個復雜而精細的過程。

首先，植物甾醇酯在口中被咀嚼和消化，釋放出脂肪酸和甾醇。這些物質在胃酸和膽汁的作用下被乳化成小顆粒，便于進一步的消化吸收。

接下來，植物甾醇酯在小腸中被胰膽固醇脂酶分解成游離型甾醇和脂肪酸。游離型甾醇可以自由地穿過腸壁進入血液中，與高密度脂蛋白結合運輸到全身各個組織。脂肪酸則被胰脂酶分解為單酰甘油和脂肪酸，單酰甘油與磷酸甘油結合形成甘油三酯，而脂肪酸則與磷酸甘油結合形成磷脂。
進入血液中的游離型甾醇可以在肝臟中被代謝為酯型甾醇，也可以被代謝為固醇類物質。固醇類物質可以進一步代謝為孕烯醇酮，孕烯醇酮可以進一步代謝為皮質激素、皮質酮、皮質醇等物質。這些物質在肝臟中被代謝為雌二醇、雌三醇、雌四醇等雌性激素，也可以被代謝為雄性激素。
植物甾醇酯的代謝產物還可以進一步代謝為雌七醇、雌八醇、雌九醇等物質，這些物質也可以進一步代謝為雌十醇、雌十一醇、雌十二醇等物質。這些物質可以進一步代謝為雌十三醇、雌十四醇、雌十五醇等物質，也可以進一步代謝為雌十六醇、雌十七烷基硫酸鈉等物質。